Durante años, el principal rival ha sido el Alicante CF, el club decano de la provincia de Alicante actualmente llamado CFI Alicante. Con el cual ha compartido durante muchos años campo y categoría, llegando a producirse enfrentamientos violentos entre aficionados y jugadores. La edición de Liga 1934-35 dejó dos resultados históricos en la historia del clásico. Otro equipo rival del Hércules es el Real Murcia Club de Fútbol, debido a la también cercanía de ambas ciudades.
