Fue hasta 1921 que Melgar logra ganar su primer trofeo de la Liga Sportiva de Arequipa, este fue en el segundo torneo organizado por esa entidad en aquel año, derrotando en la final al Independencia. En 1923 se alzaría con su segundo trofeo, este donado por la colonia española, en un torneo organizado como parte de las fiestas del descubrimiento de América, torneo denominado «Torneo de la Raza» derrotando en la final al White Star.
